О влиянии размера алфавита на статистику вторичных структур РНК и РНК-РНК комплексов

М. Тамм (МГУ)

Аннотация

Доклад посвящен статистической теории образования вторичной структуры в комплексах РНК. Автор начнёт с обсуждения общей теории образования кактусоподобных вторичных структур РНК и того, как эта теория может быть обобщена на образование РНК-РНК комплексов. Далее, для простейшей модели связывания будет описан алгоритм, позволяющий предсказывать вторичные структуры комплексов РНК по заданной первичной структуре компонент за время порядка N4.

Во второй части доклада автор обсудит статистические свойства вторичных структур случайных РНК и покажет возможность существования двух типов различных морфологий этих вторичных структур, т.н. совершенной и несовершенной, в зависимости от размера «алфавита РНК» (числа различных нуклеотидов). Будет показано, что в простейшей модели формирования вторичных структур переход от совершенных к несовершенным структурам происходит при числе нуклеотидов, равном 4.