Group of the Symmetry Research and Modeling of (Bio)Polymers

Направление исследований

Определение симметрийных закономерностей строения (био)полимеров и моделирование их симметрийно-возможных структур.

Текущие темы исследований

1. Определение структурных закономерностей строения α-спирали и объединений α-спиралей как реализаций конструкций алгебраической геометрии.
2. Выявление некристаллографической симметрии насыщенных углеводородных цепочек C_2∙(10–n)H_{2∙2(10–n)}, n=0,1,2,3 в молекулах липидов, определяющей различия в свойствах «близких по n» цепочек при одинаковых физических условиях.
3. Поиск «топологически устойчивых» геликоидально-подобных структур, способных отображать некоторые закономерности строения определенных форм ДНК.
4. Вывод неклассических симметрий геликоидов, реализующихся в полимерах (например, единого геликоида с несколькими значениями углов вращения и т.п.)

Презентация с информацией о группе (2012 год).

Гранты РФФИ:

• Построение обобщенной кристаллографии плотноупакованных тетраэдрических металлических структур как структурного приложения алгебраической геометрии, 2003-2005
• Теоретическое моделирование и расчет энергии фазового перехода «газогидрат-лед», 2005-2007
• Фундаментальные основы получения и применения некристаллических пространственно неоднородных материалов с модуляцией (дисперсией) электрических и диэлектрических параметров в диапазоне 150-300 нм и размером активных областей 5-50 нм для разработки элементной базы нового поколения твердотельной СВЧ-электроники, 2009-2010
• Построение теории и моделирование структурного механизма фазового превращения газогидрата в лёд, 2009-2011
• Теоретическое исследование атомных неоднородностей (кластеров) в твердых и жидких металлических растворах в рамках теории функционала плотности, 2011-2013

Гранты Отделения химии и наук о материалах РАН:

• ОХНМ-7, Динамика образования и изучение строения клатратных гидратов, 2003-2005
• ОХНМ-7, Теоретическое и экспериментальное исследование фазового перехода «газогидрат — лед», 2006-2008
• ОХНМ-6, Построение теории и моделирование фазового перехода «газогидрат-лед», реализуемого переброской минимального числа водородных связей, 2009-2011

Гранты Президиума РАН:

• ПРАН-«Поддержка инноваций», Моделирование процессов входа и выхода молекул гостей в газогидратах, осуществляемое теоретическими и экспериментальными методами, 2006-2008
• ПРАН «Создание и совершенствование методов химического анализа и исследования структуры веществ и материалов», Совершенствование приборной базы микроскопии для исследования объектов нанометрового уровня, 2009

Отдельные публикации последних пяти лет

• А.Л. Талис. Симметрийные закономерности строения упорядоченных тетракоординированных структур. В сб. «Исследование углерода — успехи и проблемы», М. Наука, 2007, С. 189-205.
• V.S. Kraposhin, A.L. Talis, V.G. Koshukin, A.A. Ogneva, L.I. Zinober. Structure of the cubic and rhombohedral high-pressure modifications of silicon as packing of the rod-like substructures determined by the algebraic geometry // Acta Cryst. B64, 2008, p. 26-33.
• V.S. Kraposhin, A.L. Talis, Ha Thanm Lam. The structure model of a cubic aperiodic phase ('quasicrystal without forbidden symmetry axes') // J. Phys.: Cond. Mat., 2008, v.20, 114115.
• V.S. Kraposhin, A.L. Talis, Ha Thanm Lam, J.-M. Dubois. Model for the transformation of an icosahedral phase into a B2 crystalline phase // J. Phys. Cond. Mat., 2008, v.20, 235215.
• Samoylovich M.I, Talis A.L. Symmetrical features and local phase transitions of ordered solid structures: tetravalent structures of gas hydrates // Cryst. Rep., 2009, V.54, No7. P.1101-11165.
• Samoylovich M.I., Talis A.L. Gosset helicoids: II. Second coordination sphere of eight-dimensional lattice E₈ and ordered noncrystalline tetravalent structures // Cryst. Rep., 2009, V.54, No7 P.1117-1127.
• Samoylovich M.I, Talis A.L. A special class of simple 24-vertex polyhedra and tetrahedrally coordinated structures of gas hydrates // Acta Cryst. A, 2010, V.66, P. 616-625.
• V. Kraposhin, I. Jakovleva, L. Karkina, G. Nuzhny, T. Zubkova, A. Talis. Microtwinning as a commonmechanism for the martensitic and pearlitic transformations // J. of Alloys and Compounds, DOI:10.1016, 2011.
• М.И Самойлович, А.Л. Талис. Кристаллические мультиферроики и симметрийные особенности их магнитных подсистем // Нано и микросистемная техника, 2012, No1. С.31-36.
• М.И Самойлович, А.Л Талис. Структурные закономерности геликоидально-подобных биополимеров в рамках алгебраической топологии. I. Особый класс устойчивых линейных структур, определяемых последовательностью алгебраических политопов // Кристаллография, в печати.
• М.И Самойлович., А.Л .Талис. Структурные закономерности геликоидально-подобных биополимеров в рамках алгебраической топологии II. a-спираль и ДНК // Кристаллография, в печати.